Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms