Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms