Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms