Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms