Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms