Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn5Q9WVD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn5Q9WVD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcn5Q9WVD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn5Q9WVD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn5Q9WVD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms