Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slit3Q9WVB4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Slit3Q9WVB4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Slit3Q9WVB4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Slit3Q9WVB4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slit3Q9WVB4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slit3Q9WVB4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slit3Q9WVB4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Slit3Q9WVB4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms