Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpk1Q9R0M5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpk1Q9R0M5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpk1Q9R0M5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpk1Q9R0M5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms