Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nr4a3Q9QZB6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a3Q9QZB6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr4a3Q9QZB6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nr4a3Q9QZB6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr4a3Q9QZB6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr4a3Q9QZB6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms