Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Homer2Q9QWW1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Homer2Q9QWW1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Homer2Q9QWW1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Homer2Q9QWW1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Homer2Q9QWW1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms