Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rai2Q9QVY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rai2Q9QVY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rai2Q9QVY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rai2Q9QVY8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms