Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpf2Q9JJ80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpf2Q9JJ80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpf2Q9JJ80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpf2Q9JJ80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpf2Q9JJ80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpf2Q9JJ80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 629.7 ms