Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc40a1Q9JHI9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc40a1Q9JHI9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc40a1Q9JHI9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc40a1Q9JHI9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc40a1Q9JHI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms