Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim54Q9ERP3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim54Q9ERP3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim54Q9ERP3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim54Q9ERP3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim54Q9ERP3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim54Q9ERP3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim54Q9ERP3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim54Q9ERP3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim54Q9ERP3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim54Q9ERP3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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