Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rp2Q9EPK2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rp2Q9EPK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rp2Q9EPK2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rp2Q9EPK2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rp2Q9EPK2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rp2Q9EPK2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rp2Q9EPK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rp2Q9EPK2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rp2Q9EPK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms