Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm2bQ9DAC0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2bQ9DAC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms