Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9DAA3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAA3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9DAA3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAA3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms