Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D8N1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D8N1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D8N1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D8N1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D8N1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D8N1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D8N1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D8N1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D8N1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D8N1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D8N1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D8N1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D8N1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D8N1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms