Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D7E4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D7E4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D7E4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D7E4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D7E4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D7E4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D7E4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D7E4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D7E4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D7E4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D7E4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D7E4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms