Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spsb1Q9D5L7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spsb1Q9D5L7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Spsb1Q9D5L7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spsb1Q9D5L7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spsb1Q9D5L7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms