Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chordc1Q9D1P4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chordc1Q9D1P4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chordc1Q9D1P4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chordc1Q9D1P4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chordc1Q9D1P4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms