Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbdc1Q9D0B6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pbdc1Q9D0B6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms