Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psmd8Q9CX56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd8Q9CX56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd8Q9CX56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd8Q9CX56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd8Q9CX56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms