Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yif1bQ9CX30 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yif1bQ9CX30 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yif1bQ9CX30 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yif1bQ9CX30 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms