Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Chchd1Q9CQA6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,77■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,76■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,74■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17,72■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,72■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Chchd1Q9CQA6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,69■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17,69■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17,68■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Chchd1Q9CQA6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms