Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb3bpQ9CQ82 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3bpQ9CQ82 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb3bpQ9CQ82 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb3bpQ9CQ82 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms