Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkp2Q9CQ73 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkp2Q9CQ73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp2Q9CQ73 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp2Q9CQ73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkp2Q9CQ73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms