Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lactb2Q99KR3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lactb2Q99KR3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lactb2Q99KR3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lactb2Q99KR3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lactb2Q99KR3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms