Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SptssbQ925E8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SptssbQ925E8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SptssbQ925E8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms