Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prb1Q91X93 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prb1Q91X93 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prb1Q91X93 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prb1Q91X93 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prb1Q91X93 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prb1Q91X93 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prb1Q91X93 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms