Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L3

Svil, Supervillin, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvilQ8K4L3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SvilQ8K4L3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SvilQ8K4L3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SvilQ8K4L3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SvilQ8K4L3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SvilQ8K4L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SvilQ8K4L3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SvilQ8K4L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms