Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk5rap2Q8K389 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cdk5rap2Q8K389 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cdk5rap2Q8K389 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cdk5rap2Q8K389 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk5rap2Q8K389 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk5rap2Q8K389 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk5rap2Q8K389 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk5rap2Q8K389 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms