Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Txndc11Q8K2W3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Txndc11Q8K2W3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Txndc11Q8K2W3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txndc11Q8K2W3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Txndc11Q8K2W3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txndc11Q8K2W3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txndc11Q8K2W3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms