Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkd3Q8K1Y2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd3Q8K1Y2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd3Q8K1Y2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms