Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scamp1Q8K021 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp1Q8K021 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scamp1Q8K021 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scamp1Q8K021 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scamp1Q8K021 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scamp1Q8K021 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scamp1Q8K021 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms