Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pxdc1Q8JZU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pxdc1Q8JZU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pxdc1Q8JZU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pxdc1Q8JZU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pxdc1Q8JZU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms