Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf628Q8CJ78 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf628Q8CJ78 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Znf628Q8CJ78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znf628Q8CJ78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms