Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx22Q8C084 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx22Q8C084 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx22Q8C084 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms