Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam53cQ8BXQ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam53cQ8BXQ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam53cQ8BXQ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam53cQ8BXQ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms