Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c2Q8BL74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c2Q8BL74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c2Q8BL74 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c2Q8BL74 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c2Q8BL74 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms