Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc4Q8BKW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zcchc4Q8BKW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zcchc4Q8BKW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc4Q8BKW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms