Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pknox2Q8BG99 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pknox2Q8BG99 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pknox2Q8BG99 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pknox2Q8BG99 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pknox2Q8BG99 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pknox2Q8BG99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms