Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg2bQ80XK6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg2bQ80XK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg2bQ80XK6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg2bQ80XK6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg2bQ80XK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 962.1 ms