Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plxna4Q80UG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plxna4Q80UG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plxna4Q80UG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plxna4Q80UG2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plxna4Q80UG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plxna4Q80UG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plxna4Q80UG2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxna4Q80UG2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plxna4Q80UG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plxna4Q80UG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxna4Q80UG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Plxna4Q80UG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms