Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Actn1Q7TPR4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn1Q7TPR4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn1Q7TPR4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Actn1Q7TPR4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms