Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Robo2Q7TPD3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Robo2Q7TPD3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Robo2Q7TPD3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Robo2Q7TPD3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Robo2Q7TPD3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Robo2Q7TPD3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Robo2Q7TPD3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Robo2Q7TPD3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms