Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube2oQ6ZPJ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ube2oQ6ZPJ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube2oQ6ZPJ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube2oQ6ZPJ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2oQ6ZPJ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ube2oQ6ZPJ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2oQ6ZPJ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube2oQ6ZPJ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2oQ6ZPJ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2oQ6ZPJ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2oQ6ZPJ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms