Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GcsamQ6RFH4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GcsamQ6RFH4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GcsamQ6RFH4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GcsamQ6RFH4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GcsamQ6RFH4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms