Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtifQ6PEE2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtifQ6PEE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtifQ6PEE2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtifQ6PEE2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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