Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd4aQ6PDC8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4aQ6PDC8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4aQ6PDC8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd4aQ6PDC8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4aQ6PDC8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4aQ6PDC8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4aQ6PDC8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4aQ6PDC8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4aQ6PDC8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms